Dyrektor Izby Skarbowej jest organem niezespolonej administracji rządowej podlegającym ministrowi właściwemu do spraw finansów publicznych i wykonującym zadania znajdujące się w zakresie właściwości określonej ustawowo.

Terytorialny zasięg działania Dyrektora Izby Skarbowej w Warszawie obejmuje województwo mazowieckie.

Dyrektor Izby Skarbowej jest organem nadzoru i organem podatkowym II instancji w stosunku do Naczelnika Urzędu Skarbowego.

Dyrektor wykonuje swoje zadania przy pomocy Izby Administracji Skarbowej.
Izba Administracji Skarbowej obsługuje Dyrektora w zakresie zadań organu podatkowego i organu nadzoru nad organami egzekucyjnymi, a także innych zadań określonych w przepisach odrębnych, w tym w zakresie zadań kierownika jednostki organizacyjnej.