Na podstawie przepisów ustawy z dnia 15 stycznia 2015 r. o zmianie ustawy o Służbie Celnej, o urzędach i izbach skarbowych oraz niektórych innych ustaw (Dz. U. z 2015 r. poz. 211), Izba Skarbowa w Warszawie wraz z podległymi urzędami skarbowymi stanowi jedną jednostkę budżetową.

Z dniem 1 kwietnia 2015 r. majątek Urzędu Skarbowego stał się majątkiem Izby Skarbowej.